Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SdhdQ9CXV1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SdhdQ9CXV1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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