Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms