Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Xrcc3Q9CXE6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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