Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms