Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms