Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NubplQ9CWD8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms