Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rprd1bQ9CSU0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rprd1bQ9CSU0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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