Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snw1Q9CSN1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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