Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PompQ9CQT5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PompQ9CQT5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms