Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms