Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RTRAFQ9CQE8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RTRAFQ9CQE8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RTRAFQ9CQE8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RTRAFQ9CQE8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RTRAFQ9CQE8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RTRAFQ9CQE8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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