Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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