Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim26Q99PN3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms