Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms