Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Mrpl3Q99N95 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Mrpl3Q99N95 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Mrpl3Q99N95 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl3Q99N95 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Mrpl3Q99N95 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms