Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrrtQ99MR6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms