Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms