Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TrabdQ99JY4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TrabdQ99JY4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TrabdQ99JY4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TrabdQ99JY4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrabdQ99JY4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms