Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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