Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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