Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfdQ925I7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PdgfdQ925I7 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms