Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clip1Q922J3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clip1Q922J3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms