Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cabp4Q8VHC5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms