Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rhbdd2Q8VEK2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rhbdd2Q8VEK2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms