Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms