Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39cQ8VE09 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39cQ8VE09 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39cQ8VE09 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39cQ8VE09 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39cQ8VE09 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39cQ8VE09 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ttc39cQ8VE09 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ttc39cQ8VE09 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ttc39cQ8VE09 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39cQ8VE09 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ttc39cQ8VE09 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39cQ8VE09 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ttc39cQ8VE09 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ttc39cQ8VE09 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ttc39cQ8VE09 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ttc39cQ8VE09 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ttc39cQ8VE09 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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