Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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