Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms