Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3I3

Cog6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog6Q8R3I3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog6Q8R3I3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cog6Q8R3I3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms