Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms