Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MyripQ8K3I4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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