Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms