Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf39Q8K2Z2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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