Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd3Q8K2F0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms