Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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