Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FgbQ8K0E8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FgbQ8K0E8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FgbQ8K0E8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FgbQ8K0E8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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FgbQ8K0E8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FgbQ8K0E8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms