Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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SbsnQ8CIT9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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SbsnQ8CIT9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms