Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rbm28Q8CGC6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rbm28Q8CGC6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rbm28Q8CGC6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rbm28Q8CGC6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rbm28Q8CGC6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm28Q8CGC6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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