Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brf1Q8CFK2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms