Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms