Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms