Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc9Q8CDN9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms