Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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