Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E4f1Q8CCE9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms