Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Atg4aQ8C9S8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4aQ8C9S8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Atg4aQ8C9S8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Atg4aQ8C9S8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Atg4aQ8C9S8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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