Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms