Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nek11Q8C0Q4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nek11Q8C0Q4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nek11Q8C0Q4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nek11Q8C0Q4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nek11Q8C0Q4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nek11Q8C0Q4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nek11Q8C0Q4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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