Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms