Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trerf1Q8BXJ2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trerf1Q8BXJ2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trerf1Q8BXJ2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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