Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube3dQ8BX13 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube3dQ8BX13 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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